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    《核酸的結(jié)構(gòu)》ppt課件

    《核酸的結(jié)構(gòu)》ppt課件

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    時(shí)間:2018-12-01

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    1、第二節(jié)核酸的結(jié)構(gòu)一、核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu)定義核酸中核苷酸的排列順序。由于核苷酸間的差異主要是堿基不同,所以也稱(chēng)為堿基序列??梢杂脡A基序列表示核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu)5′端3′端CGA核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu)核苷酸間的連接鍵是:3′,5′-磷酸二酯鍵相間排列的戊糖和磷酸構(gòu)成主鏈,堿基是有秩序連接的側(cè)鏈基團(tuán)線(xiàn)性核酸鏈都有一個(gè)3′-末端和一個(gè)5′-末端可以堿基序列表示核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu)AGP5?PTPGPCPTPOH3?核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)的簡(jiǎn)寫(xiě)表示5?pApGpTpGpCpT-OH3?5?AGTGCT3?核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)書(shū)寫(xiě)規(guī)則用p表示磷酸

    2、基團(tuán)。p在核苷左側(cè)時(shí),表示磷酸與糖環(huán)的5?-羥基結(jié)合;在右側(cè)表示與3?-羥基結(jié)合。舉例:pApCpGpUpApCpGpU:表示水解后C的3?-羥基連有磷酸基;pApCpGpU:表示水解后C的3?-羥基是游離的P可省略,用字母表示。pACGU簡(jiǎn)寫(xiě)式的讀向是從左到右,堿基序列是5?到3?二、DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)-雙螺旋結(jié)構(gòu)(一)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的研究背景堿基組成分析Chargaff規(guī)則:[A]=[T][G]?[C]堿基的理化數(shù)據(jù)分析A-T、G-C以氫鍵配對(duì)較合理;其他組合易相互排斥;如G:TDNA纖維有

    3、相似的X-線(xiàn)衍射圖譜,說(shuō)明DNA可能有共同的空間結(jié)構(gòu)。Chargaff規(guī)則:(1)A=T(2)G=C(3)A+C=G+T(4)A+G=C+T(二)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型要點(diǎn)(Watson,Crick,1953)DNA分子由兩條相互平行但走向相反的脫氧多核苷酸鏈組成,兩鏈以-脫氧核糖-磷酸-為骨架,以右手螺旋方式繞同一公共軸盤(pán)。堿基對(duì)糖苷鍵的角度差異,使得形成大溝及小溝相間排列。大溝和小溝處堿基基團(tuán)分布不同,可以與蛋白質(zhì)特異作用。兩個(gè)核苷酸間的夾角36°(二)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型要點(diǎn)堿基垂直螺旋軸居

    4、雙螺旋內(nèi)側(cè),與對(duì)側(cè)堿基形成氫鍵配對(duì)(互補(bǔ)配對(duì)形式:A=T;G?C)。堿基在一條鏈上的排列順序不受任何限制。但根據(jù)堿基配對(duì)原則,一條核苷酸鏈序列可決定另一條互補(bǔ)鏈的序列。雙螺旋的直徑為2nm,相鄰堿基平面距離0.34nm,螺旋一圈螺距3.4nm,一圈10對(duì)堿基。DNA分子大小常用堿基對(duì)數(shù)(bp)表示堿基互補(bǔ)配對(duì)TAGC堿基平面與縱軸垂直,糖環(huán)平面與縱軸平行(二)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型要點(diǎn)(Watson,Crick,1953)大多數(shù)天然DNA屬于雙鏈DNA,某些病毒中DNA屬于單鏈DNA.氫鍵維持雙鏈

    5、橫向穩(wěn)定性,堿基堆積力維持雙鏈縱向穩(wěn)定性。DNA,雙螺旋,正反向,互補(bǔ)鏈。A對(duì)T,GC連,配對(duì)時(shí),用氫鍵(AT2,GC3)十堿基,轉(zhuǎn)一圈,螺距34點(diǎn)中間。堿基力和氫鍵,維持螺旋結(jié)構(gòu)堅(jiān)。PS:AT2,GC3:指AT之間二個(gè)氫鍵,GC間三個(gè).螺距34點(diǎn)中間即3.4。DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)記憶歌訣①堿基堆積力形成疏水環(huán)境(主要因素)。②堿基配對(duì)的氫鍵。GC含量越多,越穩(wěn)定。③磷酸基上的負(fù)電荷與介質(zhì)中的陽(yáng)離子或組蛋白的正離子之間形成離子鍵,中和了磷酸基上的負(fù)電荷間的斥力,有助于DNA穩(wěn)定。④堿基處于雙螺旋內(nèi)部

    6、的疏水環(huán)境中,可免受水溶性活性小分子的攻擊。穩(wěn)定雙螺旋結(jié)構(gòu)的因素類(lèi)型結(jié)晶狀態(tài)螺距堿基距離每圈旋轉(zhuǎn)(nm)(nm)bp數(shù)方向A相對(duì)濕度75%2.30.25511右手DNA鈉鹽B相對(duì)濕度92%3.40.3410右手DNA鈉鹽C相對(duì)濕度66%3.10.3329.3右手DNA鋰鹽Zd(GCGCGC)4.50.3712左手三、DNA二級(jí)結(jié)構(gòu)的其他類(lèi)型DNA單鍵可以旋轉(zhuǎn),所以DNA會(huì)呈現(xiàn)不同二級(jí)結(jié)構(gòu)類(lèi)型DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的多樣性DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的多樣性Z型DNAB型DNAA型DNADNA的其他結(jié)構(gòu)類(lèi)型二重對(duì)稱(chēng)

    7、結(jié)構(gòu):一條鏈堿基序列的正讀與另一條鏈堿基序列的反讀相同。(回文順序)2.鏡像重復(fù)此重復(fù)序列可能形成三螺旋DNA結(jié)構(gòu)。三螺旋結(jié)構(gòu)可以阻止DNA的體外合成。3.四鏈結(jié)構(gòu)由串聯(lián)重復(fù)的鳥(niǎo)苷酸鏈構(gòu)成。4條主鏈平行排列。(一)定義DNA雙螺旋通過(guò)扭曲和折疊所形成的特定構(gòu)象。包括:不同二級(jí)結(jié)構(gòu)單元間的相互作用單鏈與二級(jí)結(jié)構(gòu)單元間的相互作用DNA的拓?fù)涮卣鞒菪荄NA三級(jí)結(jié)構(gòu)的主要形式。第四節(jié)DNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)超螺旋結(jié)構(gòu)(supercoil)DNA雙螺旋鏈再盤(pán)繞即形成超螺旋結(jié)構(gòu)。超螺旋DNA結(jié)構(gòu)致密,增加了其穩(wěn)

    8、定性。正超螺旋(positivesupercoil)盤(pán)繞方向與DNA雙螺旋方向相同,可增加螺旋圈數(shù)。DNA復(fù)制時(shí),可在拓?fù)洚悩?gòu)酶的作用下消除正超螺旋的扭曲張力。負(fù)超螺旋(negativesupercoil)盤(pán)繞方向與DNA雙螺旋方向相反,可減少螺旋圈數(shù)。解開(kāi)負(fù)超螺旋,雙螺旋部分區(qū)域會(huì)形成單鏈區(qū)。生物體內(nèi)以負(fù)超螺旋存在意義DNA超螺旋結(jié)構(gòu)整體或局部的拓?fù)鋵W(xué)變化及其調(diào)控對(duì)于DNA復(fù)制和RNA轉(zhuǎn)錄過(guò)程具有關(guān)鍵作用。(二)環(huán)狀DNA的三種典型構(gòu)象(1)、松弛環(huán)形DNA(開(kāi)環(huán)DNA)超螺旋DNA的一條鏈斷

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